La création de l'ASAF a été inspirée par la déclaration d'Abidjan publiée à la suite du 4ème sommet Afrique-Europe de la jeunesse du 9 au 11 octobre 2017 à Abidjan (Côte d'Ivoire). 

L'ASAF est soutenu par le Programme panafricain de l'Union européenne qui vise notamment à renforcer l'enseignement supérieur en Afrique. Ce programme soutient également des actions telles que l'initiative Tuning Africa pour l'harmonisation des programmes d'enseignement supérieur et l'initiative HAQAA pour l'harmonisation de l'assurance qualité et de l'accréditation de l'enseignement supérieur africain.

Les étapes importantes de l'ASAF comprennent quatre ateliers régionaux organisés en 2019 à travers le continent africain, où les membres de l'ASAF et les parties prenantes concernées, ainsi que l'Union européenne et l'Union africaine, ont discuté ensemble de la vision, de la mission et de l'identité de l'ASAF.

Les ateliers ont révélé une aspiration profonde à une intégration continentale plus forte, soutenue par une coopération plus étroite entre les systèmes d'enseignement supérieur très divers en Afrique. Ils ont également mis en évidence le besoin crucial de moderniser les systèmes d'enseignement supérieur et augmenter leurs normes de qualité, étant donné le rôle de l'enseignement supérieur comme moteur du développement économique et social et l'inadéquation considérable entre les compétences acquises par les jeunes et celles nécessaires à la vie personnelle et professionnelle dans la plupart des pays africains.